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中华人民共和国福州海关是直属国家海关总署管理的厅局级海关，关区范围包括福建省内福州、莆田、三明、南平、宁德5市及其所辖的40个县（市、区），总面积6.5万平方公里；关区海岸线总长1800余公里。关区内主要口岸有福州国际机场空港、福州马尾港、福清江阴港、莆田秀屿港、宁德三都澳港和武夷山机场空港等。目前，共设有17个内设机构（其中缉私局为副厅级）、3个派驻机构、8个隶属海关及2个事业单位；此外，在平潭东澳、霞浦三沙、莆田秀屿、连江琯头设有科级海关办事处，主要负责对台小额贸易监管工作。截至2006年8月，全关共有关员、警员1184 人。现任关党组书记、关长为金时锋。
作为1685年（康熙二十四年）清政府开放“海禁”后设立的4个海关之一，闽海关成为中国历史上最早正式以“海关”命名的对外贸易管理机构之一。鸦片战争后，福州被列为中国五个通商口岸之一，成为中国近代最早对外开放的重要口岸之一。1861年设立由外籍税务司管理的“闽海关”（“洋关”），宣告了福州口岸半殖民地半封建海关制度的开始。1949年10月，中华人民共和国成立，闽海关终于回到人民怀抱，1950年改称“福州海关”，并沿袭至今。57年来，尽管机构及其隶属关系几经变化，进出口监管业务几起几落，但福州海关为促进对外经济贸易和科技文化交往服务的宗旨却始终如一，尤其改革开放以来，认真贯彻党的十一届三中全会以来的路线、方针、政策，不断解放思想，更新观念，紧跟关区经济和社会发展形势，努力适应对外开放要求，通过深化业务改革，狠抓干部队伍建设，努力提高通关效率，为关区经济建设和对外开放作出了应有的贡献，一个古老而新兴的海关焕发出勃勃生机。
据统计，2005年，福州海关共监管进出口货物2449.74万吨，其中进口359.40万吨，出口2090.34万吨，同比分别增长33.23%、11.14%、37.94%；进出口货物总值118.26亿美元，其中进口51.81亿美元，出口66.45亿美元，同比分别增长3.55%、-4.61％、10.95%；征收关税和进口环节税34.09亿元，同比增长-1.15%；查获各类走私犯罪案件22起、走私行为案件30起，总案值2811万元，涉案偷逃税款597.52万元，查办违规案件213起，抓获走私犯罪嫌疑人53名。
福州关区在业务上有几个明显特点：一是业务门类比较齐全，涵盖一般贸易、加工贸易以及非贸的行邮监管，还有对台小额贸易等；二是码头点多面广，监管难度比较大；三是有众多台轮停靠点，对台小额贸易批量小、分布散；四是沿海海关和内陆山区海关并存；五是关区海岸线长，沿海岛屿众多，大陆与台湾占领的岛屿犬牙交错，海情复杂，监管和海上缉私难度大。
“雄关漫道真如铁，而今迈步从头越”。当前，福州海关正以崭新的姿态，深入贯彻胡锦涛总书记关于“政治坚强、业务过硬、值得信赖”的海关队伍建设要求和“依法行政，为国把关，服务经济，促进发展”海关工作方针，围绕福建省委提出的建设“海峡西岸经济区”战略构想，积极推进海关管理现代化步伐，提升把关服务能力，努力为祖国和平统一，为福建对外开放和经济发展奉献新业绩、作出新贡献。
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